Posts

Showing posts from October, 2018
Arlequin (version 3.0): An integrated software package for population genetics data analysis Jurnal ini memberikan penjelasan tentang kegunaan aplikasi Arlequin ver 3.0. Beberapa kegunaannya dari aplikasi ini ialah memadukan beberapa metode dasar dan lanjutan untuk analisis data genetika populasi, seperti perhitungan indeks keragaman genetik standar, perkiraan frekuensi alel dan frekuensi haplotype, tes keberangkatan dari keseimbangan tautan, keberangkatan dari netralitas selektif dan keseimbangan demografis , estimasi atau parameter dari ekspansi populasi masa lalu, dan analisis menyeluruh dari subdivisi populasi di bawah kerangka AMOVA. Arlequin 3 memperkenalkan antarmuka grafis yang benar-benar baru yang ditulis dalam C ++, sebuah analisis semantik file input yang lebih kuat, dan dua metode baru: Bayesian jatah fase gamet dari genotipe multi-lokus, dan estimasi parameter ekspansi spasial seketika dari  DNA urutan polimorfisme. Arlequin dapat menangani beberapa tipe d...